ILIM ada menyediakan beberapa program jangka masa panjang dan sederhana seperti berikut:-
- Diploma Pengurusan Islam
- Sijil Pengurusan Islam
- Sijil Tinggi Pengajian Sains Dakwah
- Sijil Tinggi Muamalat
- Sijil Tinggi Bahasa Arab
- Sijil Tinggi Falak Syarie
- Sijil Tinggi Profesionalisme Imam
- Sijil Tinggi Kaunseling Syarie, Runding Cara Kekeluargaan Islam
- Sijil Tinggi Penguatkuasa Syarie Malaysia
- Sijil Tinggi Pengurusan Fatwa
- Sijil Tinggi Pengurusan Harta dan Kewangan Islam
- Sijil Tinggi Pengurusan dan Kepemimpinan Islam
Antara kursus-kursus utama dan jangka pendek adalah:-
- Kursus Standard Penarafan Masjid Malaysia (SPMM)
- Kursus Profesionalisme Muazzin
- Kursus Profesionalisme Pendakwah*
- Kursus Pengurusan Pensijilan Halal*
- Kursus Profesionalisme Penguatkuasaan Syarie*
- Kursus Profesionalisme Pendakwaan Syariah*
- Kursus Pengurusan Kekeluargaan Islam*
- Kursus Kaunseling Syarie*
- Kursus Profesionalisme Pensyarah*
- Kursus Pemerkasaan Bahasa Inggeris*
- Kursus Pemerkasaan Bahasa Arab*
- Kursus Bahasa Isyarat dalam Ibadah*
- Kursus Pengkaedahan Jawi*
- Kursus Perancangan Strategik
- Kursus Metodologi Penyelidikan*
- Kursus Pengurusan Mesyuarat dan Pelaporan Berkualiti*
- Kursus Profesionalisme Kepemimpinan*
- Kursus Pembangunan Perkaderan PHEI*
- Kursus Pengurusan Konflik dan Krisis
- Kursus Creative Thinking and Problem Solving
- Kursus Pengurusan Organisasi Cemerlang
- Kursus Pembudayaan Korporat
- Kursus Coaching and Mentoring
- Kursus Kejurulatihan Profesional*
- Kursus Pengurusan Majlis Rasmi & Protokol*
- Kursus Penulisan Dakwah Kreatif
- Kursus Tafaqquh Fiddin
- Kursus Falak Syarie
- Kursus Pengurusan Fatwa
- Kursus Fiqh Awlawiyyat dan Maqasid*
- Kursus Ulum Quran dan Hadith
- Kursus Akidah dan Pemikiran Islam*
*Kursus mempunyai beberapa tahap/ modul